Né à Colmar le 5 octobre 1932, fils de Charles Paul Neidhardt (Goxwiller [Bas-Rhin] 1888-Colmar 1967), notaire, et d’Yvonne Anna Stéphanie Kienlin (Paris 1906-Besançon 2001). Vivant à Sélestat, sa famille quitte l’Alsace lors de l’Exode en 1940 pour s’installer en Algérie. Études à la faculté mixte de médecine et de pharmacie d’Alger à partir de 1949. Internat le 2 novembre 1954. Thèse : « Les anomalies de l’angle colique gauche dans le dolicolon » (1961). Nommé à Lyon après la disparition de la faculté de médecine d’Alger en 1962, il est professeur d’anatomie, chirurgien des hôpitaux. Le caractère vivant et passionnant de son enseignement d’anatomie est devenu légendaire à Lyon. Carrière intégralement en chirurgie d’urgence. Doyen de la faculté de médecine Lyon-Nord de 1977 à 1980. J.-P. H. Neidhardt a développé l’enseignement et le séminaire d’histoire de la médecine, dont il est l’animateur principal.
Élu correspondant le 3 décembre 1985, puis titulaire le 4 décembre 1990 du fauteuil 3, section 3 Sciences. Discours de réception le 10 décembre 1991: Les derniers Goths (MEM 46, 1992). Président en 2008 ; émérite le 7 décembre 2010. Communications : 9 novembre 1983, Les aspects modernes des blessures de guerre (MEM 38, 1984) ; 26 mars 1985, La guerre des paysans (1523-1526) (MEM 40, 1986) ; 3 avril 1990, Quelques aspects de la flore forestière de l’Afrique du Nord (MEM 45, 1991) ; 19 mars 1996, Quelques aspects historiques de la peine de mort (MEM 50, 1996) ; 27 mars 1999, Quelques aspects de l’histoire des populations de l’Afrique du Nord (MEM 55, 2000) ; 15 mai 2001, Un amiral très chirurgical : Horatio Nelson (1758-1805) (MEM 2, 2002) ; 20 septembre 2005, Les Alsaciens en Algérie (MEM 5, 2005) ; 8 janvier 2008, Du Moyen Âge à la Renaissance : Comparaison de quatre chirurgiens (MEM 9, 2009) ; 2 décembre 2008, Promenade en Alsace romane (MEM 9, 2009) ; 6 avril 2010, Les malgré nous (MEM 11, 2011).
Membre de la Société de chirurgie de Lyon, membre correspondant de l’Académie de chirurgie.
Avec Kraft, Rousson, Roubin, Charroux, Morin, « Traitement à ventre ouvert de certaines péritonites et infections pariétales abdominales graves. Technique personnelle », Lyon Chir. 75, 1979, p. 272-274. – Avec Kraft, Rousson, Morin, Roubin, Charroux, « Actualité persistante de la gangrène gazeuse », Ibidem, p. 281-288. – « Les entérocolites nécrosantes », Lyon Méd. 244, p. 1980, 239-247. – « Le service d’urgence spécialisé. Bilan de l’expérience lyonnaise », 82e congrès français de chirurgie, Paris, sept. 1980, Actualités Chirurgicales, 1981. – « Problèmes psychologiques en chirurgie d’urgence », Rev. Méd. et Psych. Méd. de la Suisse Romande 14, 1982, p. 2233-2236. – « Chirurgie de guerre et urgences civiles », Chirurgie 107, 1981, p. 647-649. – « Une nouvelle race de chirurgiens », Lyon Chir. 93, 1997, p. 141-142.