Jean-Noël Guinot est né le 26 décembre 1941 à Valence (Drôme), fils de Raymond Guinot, expert-comptable, et de Suzanne Sauvajon. Il fait ses études secondaires à Valence et ses études supérieures aux facultés catholiques de Lyon et à l’université de Lyon (devenue Lyon‑2). Il obtient une licence ès lettres classiques en 1964, un diplôme d’études supérieures sur Grégoire de Nazianze : Apologeticus de fuga (Discours 3) en 1965, passe l’agrégation de lettres classiques en 1968 et soutient en juin 1975 à l’université Louis Lumière Lyon 2 une thèse d’État intitulée : L’exégèse de Théodoret de Cyr d’après son commentaire « In Isaiam », avec dans son jury Jean Pouilloux* (directeur de thèse) et le père Claude Mondésert*. Il enseigne à partir de 1967 à Lyon, Montréal (Canada), Saint-Étienne, puis à Lyon au lycée Ampère (1975-1978), dans les classes préparatoires du lycée Édouard-Herriot (1978-1982), et il donne des vacations de grec aux universités Jean-Moulin Lyon-3 et Lumière Lyon-2 (1979-1988). En 1982, il entre au CNRS, dans l’équipe de l’Institut des Sources chrétiennes. D’abord adjoint au Père Dominique Bertrand* à la direction de la collection « Sources chrétiennes », il lui succède dans cette fonction en 1994. En 1999, c’est à la direction de l’Institut des Sources chrétiennes qu’il prend la suite du Père Bertrand, jusqu’en 2006. Son domaine de recherche concerne l’exégèse patristique grecque au ive et au ve siècle, celle d’Antioche et de Théodoret de Cyr en particulier, les rapports entre exégèse et débats doctrinaux au v^e siècle (la crise nestorienne), du concile d’Éphèse (431) au concile de Chalcédoine (451).