L'Académie des sciences, belles-lettres et arts de Lyon s'exprime rarement sur les affaires publiques. Mais il lui arrive de prendre position lorsqu'il s'agit de questions scientifiques ou culturelles d'importance et lorsque la liberté de recherche ou de diffusion n'est plus assurée.
C'est ainsi qu'elle a protesté, avec l'Académie française, en 1827, contre la loi de censure. C'est ainsi qu'elle s'est associée en 2015 aux actions pour sauver le Musée des Tissus, menacé de dispersion et de fermeture. C’est ainsi encore qu’elle a exprimé sa solidarité avec les scientifiques, ukrainiens comme russes, au moment du déclenchement de la guerre en Ukraine.
Elle manifeste aujourd'hui son inquiétude et sa stupeur face aux fermetures brutales d'agences, de laboratoires ou de crédits aux États-Unis, qui remettent en cause des programmes de recherche, non seulement états-uniens, mais aussi à participation mondiale. Elle exprime donc, comme de nombreuses sociétés savantes, sa solidarité avec le mouvement multiforme "Stand up for science".